Szkoła im. św. Jana Pawła II prowadzona jest przez CFD pod patronatem Komisji Episkopatu Polski ds. Duchowieństwa. Program zajęć oparty jest na głównych tematach antropologicznych i teologicznych adhortacji Pastores dabo vobis i Verbum Domini. Szkoła ma cykl dwuletni i obejmuje 10 sesji pięciodniowych i dwie serie rekolekcji ośmiodniowych. Przyjmowane są do niej osoby zaangażowane w pracy formacyjnej lub przeznaczone do niej w najbliższej przyszłości: rektorzy, dyrektorzy studiów, prefekci, ojcowie duchowni, mistrzowie nowicjatów i postulatów. Warunkiem uczestnictwa jest zobowiązanie się w porozumieniu z przełożonymi do udziału we wszystkich sesjach i rekolekcjach dwuletniego cyklu Szkoły.

Sesja I

1. Modlitwa słowem Bożym. Lectio divina - droga Piotra - Ewangelie.

2. Wykłady. Powrót do korzeni własnego powołania:

• historia zbawienia i historia mojego zycia
• historia mojej relacji z Bogiem i mój obraz Boga
• historia relacji międzyludzkich: zranienia w relacjach i ich uzdrawianie
• historia powołania kapłańskiego: rozeznawanie, decyzje, kryzysy

3. Warsztaty: spotkanie integracyjne